树干区别：黑骨茶树皮、树根呈黑色，木质坚硬；小叶紫檀树皮呈深褐色。叶子区别：黑骨茶叶子很小，互生，呈鸡心形，叶子革质；小叶紫檀通常长有3到5片小叶，呈椭圆形。花朵区别：黑骨茶的花朵呈白色，生在叶腋处；小叶紫檀花朵黄色或是带有黄色条纹。

一、树干区别

黑骨茶属于灌木类，树皮和树根都呈黑色，木质非常的坚硬。

小叶紫檀属于乔木，树干通直，树皮呈深褐色，会深裂呈长方形薄片，树干的树液呈深红色。

二、叶子区别

黑骨茶的叶子很小，并且互生，呈鸡心形，叶子呈革质，叶色非常的浓绿，它的新芽呈嫩红色。

小叶紫檀通常长有小叶3到5片，形状一般为椭圆形或是卵形，长大约9到15厘米。

三、花朵区别

黑骨茶的花朵很小，颜色呈白色，通常生在叶腋处。

小叶紫檀的花朵黄色或是带有黄色的条纹，花期在11月到12月份。